USU-IR Home    USU Library        Feedback

USU Institutional Repository » Master Theses (MT) » Medicine » MT - Biomedik »

Please use this identifier to cite or link to this item:

http://repository.usu.ac.id/handle/123456789/33327


Title: Deteksi Mycobacterium tuberculosis pada Sputum Penderita Tuberkulosis Paru Basil Tahan Asam Negatif dengan Reaksi Rantai Polimerase
Authors: Andina, Meizly
Advisors: Siregar, Yahwardiah
Amir, Zainuddin
Issue Date: 12-Jul-2012
Abstract: Pulmonary tuberculosis is an infectious disease remains a public health problem in Indonesia and around the world. Tuberculosis (Tb) is an infectious disease caused by rod-shaped bacteria (bacilli), known as Mycobacterium tuberculosis in most developing countries, the examination of acid-fast bacilli smear, culture and radiological examination was used as a method of diagnosis of tuberculosis in humans. Advanced techniques for the diagnosis of M. rapid and specific tuberculosis is highly emphasized the need for eradication of tuberculosis. Detection of M. tuberculosis by polymerase chain reaction plays an important role for the diagnosis of smear negative cases, early diagnosis of infection, monitoring response to treatment, to determine drug resistance in patients and confirm the certainty of free M. tuberculosis. The purpose of this study was to detect M. tuberculosis in patients with pulmonary tuberculosis sputum acid-fast bacilli staining (AFB) negative by polymerase chain reaction. A total of 36 samples of sputum smear-negative pulmonary TB patients coming from Haji Adam Malik Hospital, General Hospital dr. Pirngadi and Lung Diseases Clinical Centre Medan examined crosssectional descriptive method. Detection of M. tuberculosis carried out using semi-quantitative PCR techniques SYBR Green I-based gene targeting IS6110 and primers T4 and T5. Sputum samples decontaminated with NALC-NaOH method is then performed by the method of DNA extraction spin columns. From all 36 samples of sputum smear-negative pulmonary TB patients from 25 men and 11 women, aged 17-78 years found a positive PCR test results were 13 samples (36.11%) and negative PCR results of 23 samples (63.88%). PCR can be used to support the diagnosis when the clinical, radiological support pulmonary Tb with negative sputum smear microscopic, so no need to wait for culture results for two months. PCR is also an examination of the very useful, fast and effective anti-TB treatment monitoring in patients and confirm the certainty of free M. tuberculosis. The weakness of the PCR test is able to give positive results even though there are only 1-10 germs or bacteria in the examination of specimens dead / dormant and contamination from other specimens. However, in this study has been carried out of action - preventive action to avoid false positives such as the arrangement and the sterilization room, the discipline of working procedures, selection and sterilization of equipment / materials and methods used.
Abstract (other language): Penyakit tuberkulosis paru merupakan penyakit infeksi yang masih menjadi masalah kesehatan masyarakat di Indonesia maupun di berbagai belahan dunia. Tuberkulosis (Tb) adalah suatu penyakit infeksi yang disebabkan bakteri berbentuk batang (basil) yang dikenal dengan nama Mycobacterium tuberculosis Di kebanyakan negara berkembang, pemeriksaan hapusan basil tahan asam, kultur dan pemeriksaan radiologis masih digunakan sebagai metode diagnosis tuberkulosis pada manusia. Teknik mutakhir untuk diagnosis M. tuberculosis yang cepat dan spesifik merupakan kebutuhan yang sangat ditekankan untuk eradikasi penyakit tuberkulosis. Deteksi M. tuberculosis berdasarkan reaksi rantai polimerase memegang peranan penting untuk diagnosis kasus smear negatif, diagnosis awal infeksi, monitoring respon pengobatan, menentukan resistensi obat pada pasien serta konfirmasi kepastian bebas M. tuberculosis. Tujuan penelitian ini adalah untuk mendeteksi M. tuberculosis pada sputum penderita tuberkulosis paru pewarnaan basil tahan asam (BTA) negatif dengan reaksi rantai polimerase. Sebanyak 36 sampel sputum penderita Tb paru BTA negatif yang berasal dari Rumah Sakit Haji Adam Malik, Rumah Sakit Umum dr. Pirngadi dan Balai Pengobatan Penyakit Paru Medan diteliti dengan metode deskriptif crosssectional. Deteksi M. tuberculosis dilaksanakan menggunakan teknik semi-kuantitatif PCR berbasis SYBR Green I dengan target gen IS6110 serta primer T4 dan T5. Sampel sputum didekontaminasi dengan metode NALC-NAOH selanjutnya dilakukan ekstraksi DNA dengan metode spin kolom. Dari seluruh 36 sampel sputum penderita Tb paru BTA negatif dari 25 orang laki-laki dan 11 orang perempuan, usia 17-78 tahun didapatkan hasil pemeriksaan PCR positif adalah 13 sampel (36,11%) dan hasil pemeriksaan PCR negatif 23 sampel (63,88%). Pemeriksaan PCR dapat dipergunakan untuk menunjang diagnosis apabila klinis, radiologis mendukung Tb paru dengan sputum mikroskopis BTA negatif, sehingga tidak perlu menunggu hasil biakan selama dua bulan. PCR juga merupakan pemeriksaan yang sangat berguna, cepat dan efektif untuk monitoring pengobatan anti Tb pada pasien serta konfirmasi kepastian bebas M. tuberculosis. Kelemahan dari uji PCR adalah dapat memberikan hasil positif walaupun hanya terdapat 1-10 kuman dalam spesimen pemeriksaan ataupun kuman mati/dormant dan kontaminasi dari spesimen lain. Namun dalam penelitian ini telah dilakukan tindakan – tindakan pencegahan untuk menghindari false positif seperti penataan dan sterilisasi ruangan, kedisiplinan dalam prosedur kerja, pemilihan dan sterilisasi alat/bahan serta metode yang digunakan.
Keywords: Mycobacterium tuberculosis
smear-negative staining
PCR
URI: http://repository.usu.ac.id/handle/123456789/33327
Appears in Collections:MT - Biomedik

Files in This Item:

File Description SizeFormat
Cover.pdfCover485.76 kBAdobe PDFView/Open
Abstract.pdfAbstract452.73 kBAdobe PDFView/Open
Chapter I.pdfChapter I464.83 kBAdobe PDFView/Open
Chapter II.pdfChapter II625.05 kBAdobe PDFView/Open
Chapter III-V.pdfChapter III-V606.95 kBAdobe PDFView/Open
Reference.pdfReference462.28 kBAdobe PDFView/Open
Appendix.pdfAppendix1.96 MBAdobe PDFView/Open
 

Items in USU-IR are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.